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一踏出綠島航空站，就可看見離出口處不遠的綠島遊客中心，是遊客遊覽綠島的第一站，也能夠令人在短時間內快速了解綠島之美，是潛水的天堂。遊客中心內不僅提供各種旅遊摺頁，也設有展示館、視聽室，介紹綠島的地理、朝日溫泉如何形成的原理，以及水芫花、梅花鹿、椰子蟹等動植物生態，豐富的展覽，配上栩栩如生的模型、動物標本，模擬出綠島的生態，絕對讓人印象十分深刻。

除了看遊客中心內的常設展之外，綠島遊客中心也販售了綠島相關紀念品與出版品，為旅客留下到此一遊的紀念與美好回憶。